更麻烦的是，如果病毒和肝细胞两者的遗传物质整合到一起的话，单靠免疫系统很难将之清除，所以乙肝自然转阴的病例是很少很少的。

如果肝细胞长期处于这种损伤、修复的循环，再生的细胞就会逐渐失去原来正常的结构和功能，发展为肝硬化，进而发展为肝癌。中国是著名的肝炎大国，目前卫计委公布的乙肝患者和携带者数量大概在1亿左右，无论是数量还是比例都是世界之最。“肝炎——肝硬化——肝癌”三部曲，是中国肝癌高发的最主要原因。

除此之外，不良的饮食习惯也是诱发肝癌的原因。黄曲霉一般产生于各自发霉的食物，尤其是坚果如花生、核桃、玉米、通心粉、调味品、牛奶、奶制品、食用油等制品之中。这种真菌会释放黄曲霉素，这是一种1级致癌物，致癌作用极强，与肝癌的关系非常密切。还有，农村饮用被蓝绿藻类污染的水源也可能增加肝癌的风险。

另外，肝癌还与年龄、性别有关系。肝癌的高发年龄是50~60岁，男性要明显高于女性。